一、本套書以明代李時珍著《本草綱目》（金陵版胡承龍刻本）為底本，以金陵版排印本（王育杰整理，人民衛(wèi)生出版社，2016年）及金陵版美國國會圖書館藏全帙本為校本，按原著的分卷和排序進行內容編排，即按序列、主治、水部、火部、土部、金石部、草部、谷部、菜部、果部、木部、服器部、蟲部、鱗部、介部、禽部、獸部、人部的順序進行編排，共分20冊。二、本套書中“釋名”“主治”“附方”等部分所引書名多為簡稱，如：《本草綱目》簡稱《綱目》，《名醫(yī)別錄》簡稱《別錄》，《神農本草經》簡稱《本經》，《日華子諸家本草》簡稱《日華》，《肘后備急方》簡稱《肘后方》，等等。三、人名書名相同的名稱，如吳普之類，有時作人名，有時又作書名，情況較復雜，為統一起見，本次編寫均按原著一律不加書名號。四、原著《本草綱目》中的部分中草藥名稱，與中醫(yī)藥學名詞審定委員會公布名稱不一致的，為了保持原著風貌，均保留為原著形式，不另作修改。五、本套書為保持原著風貌，對原著之服器部和人部的內容全文收錄，但基本不配圖。六、本套書依托原著的原始記載，根據作者們多年野外工作經驗和鑒定研究成果，結合現有考證文獻，對《綱目》收載的藥物進行了全面的本草考證，梳理了古今藥物傳承關系，并確定了各藥物的基原和相應物種的拉丁學名；對于多基原的藥物均進行了綜合分析，對于部分尚未能準確確定物種者也有表述。同時，基于現代化、且普遍應用的DNA條形碼鑒定體系，在介紹常用中藥材之《藥典》收載情況的同時附上其基原物種的通用基因堿基序列。由此古今結合、圖文并茂，豐富閱讀鑒賞感受，并提升其實用參考和珍藏價值。七、本套書結合現實應用情況附有大量實地拍攝的原動植物（及礦物等）和藥材（及飲片）原色圖片，方便讀者認藥和用藥。八、部分藥物尚未能解釋科學內涵，或者療效有待證實、原料及制作工藝失傳，以及其他因素，故無考證內容及附圖，但仍收載《綱目》原始內容，有待后來者研究、發(fā)現。
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