到了明初，情況又有了改變。政府重點是辦理官學(xué)，提倡科舉，不重視書院，自洪武至成化100多年的情況就是這樣。成化（1465—1487年）以后，書院才又得復(fù)興。至嘉靖年間（1522—1566年）達到極盛。明代書院由衰到興，王守仁、湛若水等理學(xué)大師起了重要的作用。為了宣揚他們的理學(xué)，他們所到之處，創(chuàng)建書院。明代末年影響最大的是東林書院。在這個書院里，師生除教學(xué)活動外，還積極參與當時的政治活動。這當然受到統(tǒng)治者的迫害，天啟五年（1625年），太監(jiān)魏忠賢下令拆毀天下書院，首及東林，興起了中國歷史上有名的迫害東林黨人的大案。

到了清初，統(tǒng)治者采取了對書院抑制的政策。一直到雍正十一年（1733年）才令各省會設(shè)書院，屬官辦性質(zhì)。以后發(fā)展到了2000余所，數(shù)量大大超過前代；但多數(shù)由官方操縱，完全沒有獨立自主的權(quán)力，因而也就沒有活力。也有少數(shù)帶有私人性質(zhì)的書院，晚清許多著名的學(xué)者在其中講學(xué)。

統(tǒng)觀中國1000多年的書院制，可以看到，書院始終是封建教育的一個重要組成部分，與統(tǒng)治者既有調(diào)和，又有斗爭。書院這種形式還影響了日本、朝鮮和東南亞一些國家。

這樣的書院制有些什么特點呢？毛禮銳主編的《中國教育史簡編》對中國書院的特點做了很好的歸納。我現(xiàn)在簡要地敘述一下。他認為特點共有五個：

1.教學(xué)與科研相結(jié)合

書院最初只是學(xué)術(shù)研究機關(guān)，后來逐漸成為教學(xué)機構(gòu)。教學(xué)內(nèi)容多與每一個時代的學(xué)術(shù)發(fā)展密切聯(lián)系。比如南宋理學(xué)流行，書院就多講授理學(xué)。明代王守仁等講一種新的理學(xué)“心學(xué)”，于是書院也講心學(xué)。到了清代，漢學(xué)與宋學(xué)對立，書院就重經(jīng)學(xué)，講考證。

2.盛行“講會”制度，提倡百家爭鳴

在南宋，朱熹和陸九淵代表兩個不同的學(xué)派。淳熙二年（1175年），兩派在鵝湖寺進行公開辯論。淳熙八年（1181年），朱熹邀請陸九淵到自己主持的白鹿洞書院去講學(xué)，成為千古佳話。明代“講會”之風更盛。王守仁和湛若水也代表兩大學(xué)派，互相爭辯。這種提倡自由爭辯的講會制度，一直延續(xù)到清代。

3.在教學(xué)上實行門戶開放

一個書院著名學(xué)者講學(xué)，其他書院的師生均可自由來聽，不受地域限制和其他任何限制。宋、明、清三代都是如此。

4.學(xué)習(xí)以個人鉆研為主

書院十分注重培養(yǎng)學(xué)生的自學(xué)能力，非常重視對學(xué)生的讀書指導(dǎo)。宋、元、明、清一些大師提出了不少的讀書原則。有的編制讀書分年日程。有的把書院的課程分門別類，把每天的課程分成若干節(jié)。他們都注意學(xué)生的全面發(fā)展。導(dǎo)師決不提倡學(xué)生死記硬背，而是強調(diào)學(xué)生讀書要善于提出疑難，鼓勵學(xué)生爭辯，教學(xué)采用問難論辯式。朱熹特別強調(diào)：“讀書須有疑”，“疑者足以研其微”，“疑漸漸解，以至融會貫通，都無所疑，方始是學(xué)?！眳巫嬷t更提出求學(xué)貴創(chuàng)造，要自己獨立鉆研，各辟門徑，不能落古人窠臼?？偟木袷且獙W(xué)生不斷有發(fā)明創(chuàng)造。

5.師生關(guān)系融洽

中國教育素以尊師愛生為優(yōu)良傳統(tǒng)。這種精神在私人教學(xué)中表現(xiàn)得尤為突出。書院屬于私人教學(xué)的范疇，所以尊師愛生的傳統(tǒng)容易得到體現(xiàn)，在官辦學(xué)校中則十分困難。朱熹曾批評太學(xué)師生關(guān)系：“師生相見，漠然如行路之人”。他指出，其原因在于學(xué)校變成了“聲利之場”，教學(xué)缺乏“德行道藝之實”。他自己身體力行，循循善誘，對學(xué)生有深厚感情。但是，他對學(xué)生要求極嚴，卻不采取壓制的辦法。他說：“嘗謂學(xué)校之政，不患法制之不立，而患理義之不足以悅其心。夫理義不足以悅其心，而區(qū)區(qū)于法制之末以防之，其猶決湍之水注千仞之壑，而作翳蕭葦以捍其沖流也，亦必不勝也?！保ㄒ姟痘奚n文集》，卷74）這些話到了今天還很值得我們玩味。明代王守仁也注意培養(yǎng)師生感情。明末的東林書院，師生感情更是特別深厚。